人皇轩辕果然如妖师鲲鹏所言那样，在广成子等阐教诸仙的鼓动下对九黎部落展开了围杀，不过九黎部落提前得到了精卫与悟道的通知，早已离开了原先的居住地，让轩辕大军扑了个空，轩辕无奈之下也只能下令人族其他部落不要与九黎部落断绝一切往来，这使得九黎部落逐渐脱离了人族。
轩辕统一人族之后，除了迫害九黎部落之外，其它方面做得还算可以，他的元妃螺祖十分贤惠，创造出了种桑养蚕，抽丝编绢之术，在她的辅助下轩辕渐渐取得了人族的认同。不过到了晚期，轩辕因自身杀伐过重一直没能功德圆满，成就人皇大道。这时他心中不由地焦急万分，广成子身为人皇之师也是万分着急，人皇一日不证道他就不能分得人皇之功德，可惜他并不知道由于自己的过错，即使轩辕成就人皇之道他也得不到多少功德。
广成子几经思索之后终于想出了一个让轩辕快速证得人皇大道之法，也就是采阴补阳双修大法，轩辕也正苦恼自己不知何时能证得大道，在得到广成子的双修大法之后，广聚天下美女，最终采百女元阴而成仙，证得人皇之道，于是后世就有了轩辕御百女而成仙之说。
轩辕功德圆满证得人皇大道，可惜他自身杀孽过重，又采百女元阴损及自身功德，虽然有天道庇护证得大道，但他损伤功德太多，在人间的威望远不能与天皇伏羲、地皇神农相比，在他证道之时诸圣之中也只有人教教主太上老君与阐教教主元始天尊前来观礼，其他诸圣都觉得轩辕对自己传道没有太大作用，而且看他在人族的处事方式，并没有什么太大的作为，所以没有前去观礼，鲲鹏为人族圣师本应前往，但他几次劝告轩辕无果，心中也是气愤并没有前往。伏羲与神农为人皇自当前往观礼，看着轩辕，神农心中十分自责，是自己没有选好继承人才导致了人族遭受如此巨大的损失。
如此以来轩辕证道也是三皇之中观礼最为简陋的，太上老君为人教教主，名义上人皇归他所管辖，所以他不得不来观礼，元始天尊则是轩辕的师祖也不得不前来观礼。
轩辕功德圆满天降功德，让元始天尊与太上老君感到震惊的是，他所得之功德与天皇伏羲、地皇神农相比相差太大，也仅仅将自身修为提升到了大罗金仙后期，而人皇之师广成子则只得了一小缕的功德，这还是因为他是人皇的结果，否则恐怕这些功德只能让他有金仙后期的修为，这样的结果让元始天尊与太上老君感到不可思意。
元始天尊疑惑向太上老君问道：“大师兄，为何轩辕身为人皇所得功德会如此之小，与伏羲、神农相比这差距也太大了些？”
太上老君沉思片刻，说道：“天意如刀，天道至公，轩辕虽为天道所眷顾，但他在继位之后，对人族并没有太大的贡献，唯一的功德也只是统一了人族，可在这个过程中他所遭成的杀孽过重，之后为了证道又采百女元阴大伤天和，如果不是他的元妃螺祖有大功德为他洗去了不少的杀孽，那么以他的所作所为恐怕也只能有金仙的修为，你再想想天皇伏羲、地皇神农，他们二人中那一位不是为人族发展做出了重大的贡献，轩辕的行为与他们相比有着天地之差。”
三皇之中以轩辕的私心最重，在功德圆满之时将人皇之位传给了自己的孙子颛顼，由此三皇时代结束，洪荒进入五帝的时代。
轩辕虽然功德圆满成就人皇大道，但阐教辅助轩辕的结果却是十分失败，这让洪荒所有大神通者看了笑话，阐教的脸面丢尽。
在颛顼继位之后，元始天尊以惩罚为名，再次让广成子辅助颛顼，元始天尊的此举，再次让阐教暗中波涛汹涌，不但是燃灯对元始天尊不满，就连慈航道人、普贤真人、文殊广法天尊、惧留孙他们四人也对元始天尊如此偏爱广成子有所不满，也正是因此在后来的封神大劫中他们四人跟随燃灯一起叛教加入佛教。
颛顼继位听从广成子的鼓惑进行了一次宗教改革，传令人族所有部落禁制信奉巫教，所有巫师不得参拜鬼神。颛顼想通过此举彻底禁绝巫教，强令人族听从他的安排，可以说颛顼的性格完全与轩辕相同，都是急功尽力，不顾百姓的感受，所以在颛顼继位后，人族好不容易稳定下来的生活又开始动荡起伏。
在轩辕在位之时被迫迁移的九黎部落，在得知颛顼这一举动后，又开始行动起来，到处拉拢反对颛顼的部落及人员，随着九黎部落的再次出现，人族许多部落也开始对颛顼的命令是阴奉阳违，完全不将其当回事。
颛顼的皇位不比当年轩辕，轩辕受天道所眷顾，得诸圣认可，而颛顼的继位也只有人、阐两教圣人认可，广成子在得知人族的动乱之后没有吸取上次的教训，反而再次拿出当年的方法，以武力镇压人族那些不听命令的部落，这使九黎部落迅速地壮大起来。
此时九黎部落以大巫九凤为首，壮大后的九黎部落兵锋直指颛顼，此时人族之中只有广成子一人辅助颛顼，而人族在军自轩辕战胜蚩尤之后便有些散漫，而九黎部落自蚩尤被封印后，一直是卧薪尝胆苦练兵马，可谓是兵强马壮，双方一交兵颛顼大军便是一败涂地。
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